Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms