Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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