Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms