Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc130Q9D516 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc130Q9D516 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc130Q9D516 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc130Q9D516 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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