Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lonrf3Q9D4H7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lonrf3Q9D4H7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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