Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stag1Q9D3E6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stag1Q9D3E6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms