Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms