Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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