Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spns3Q9D232 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms