Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms