Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddx56Q9D0R4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx56Q9D0R4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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