Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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