Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc47Q9D024 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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