Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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