Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms