Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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