Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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