Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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