Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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