Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms