Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms