Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Atp6v0e1Q9CQD8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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