Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Timm22Q9CQ85 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms