Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms