Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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