Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms