Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cep41Q99NF3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms