Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PtprtQ99M80 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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