Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdpd3Q99LY2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms