Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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