Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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