Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms