Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb1Q8VHS2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms