Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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