Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Commd9Q8K2Q0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Commd9Q8K2Q0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd9Q8K2Q0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms