Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nek9Q8K1R7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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