Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn34c1Q8K193 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn34c1Q8K193 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn34c1Q8K193 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn34c1Q8K193 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn34c1Q8K193 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c1Q8K193 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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