Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrit1Q8K099 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms