Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms