Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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