Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms