Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc28aQ8CEI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms