Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufl1Q8CCJ3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms