Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atg4aQ8C9S8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms