Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms