Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc12Q8BW49 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc12Q8BW49 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc12Q8BW49 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc12Q8BW49 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc12Q8BW49 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc12Q8BW49 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc12Q8BW49 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc12Q8BW49 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms