Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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