Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssc5dQ8BV57 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssc5dQ8BV57 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms