Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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