Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms